移动环保厕所的无水冲污物处理方式，让很多缺乏资源的地方也用上了移动环保厕所，不但不需要大量的水资源储备，相反可以通过生物反应的方式，把尿液净化为可以冲洗厕所的水储存起来，无水冲移动环保厕所分为粪便打包和无水生物处理两种。
粪便打包：粪便打包移动环保厕所的核心是由可生物降解的薄膜包装袋、机械设备和储物箱组成。厕所从厕所取下后，牵引装置启动排泄物的包装和密封，避免异味外泄。包装物的粪便由卫生科收集，送到粪便处理场进行无害化处理。使用卫生间的环境中，不留残液，不需要水。
无水生物处理：无水生物处理移动环保厕所的核心是生物反应器，它具有生物填料的时间补充功能。滑移反应器的粪便受微生物作用降解，反应过程的高温能消除各种病原体。粪便发酵后，主要成分是腐殖有机肥。肥料可直接出售，可用于绿化工程。
这种移动环保厕所仅收集尿液，参加一种药物来去除异味，然后回去冲厕所。粪便分解成纸浆，可作为肥料返回田间，也可用于填埋处理。国内蓝杰斯生态厕所是这样的。日本也有类似的加工设备，它是一种专门计划的粪便分离设备，能够完成粪便的分离。尿液经微生物处理，去除氨氮等恶臭气体冲洗，粪便经生物处理后运输。
这是目前国内
移动环保厕所的主流产品。通过环境工程技术、微生物创新效应和物理化学效应的使用，粪尿污染物降解的结束，最终转化为ＣＯ２和水排放到环境中，加上清水代用于冲洗厕所或直接排放到环境中。
